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動物保護や愛護推進を目的とするNPO法人を設立するには、NPO法（特定非営利活動促進法）に基づいて所轄庁（都道府県や政令指定都市など）への申請が必要です。設立発起人や定款、活動目的、収支計画などの書類を整え、所轄庁の審査を経て認証を受ける流れとなります。その後、法務局で法人登記を行うことで正式にNPO法人として活動を開始できます。動物関係団体としては、保護活動のほか里親探しや啓発セミナーなど多岐にわたる事業を想定し、収支バランスや寄付の取り扱いを透明化することが求められます。

獣医師が不適切な診療や手術ミスを行い、ペットが死亡または重い後遺症を負った場合、飼い主は獣医師に対して民事上の損害賠償を請求できる可能性があります。ただし医療過誤訴訟と同様に、「獣医師の過失があったこと」「その過失とペットの死亡・障害との因果関係」を立証する必要があり、専門的な証拠が求められます。動物は「物」として扱われるため、命の価値が損害賠償額に直接反映されにくいのが実情ですが、近年は家族同然という考え方が広がりつつあり、裁判所の慰謝料判断に影響が出始めています。

改正動物愛護管理法に基づき、2022年6月1日から犬・猫の販売業者はマイクロチップ装着が義務となりました。一般の飼主にも装着努力義務が課されていますが、現状では飼主による自主的装着を推奨している形です。販売業者が装着・登録を済ませたうえで購入者へ引き渡し、その後は新たに飼い主が変更登録を行う流れが基本です。これにより迷子犬・迷子猫が保護された際、所有者特定が容易になると期待されています。

SNSで動物を虐待する映像や画像を自慢げに投稿する行為は、動物愛護管理法違反となる可能性が非常に高いです。悪質な場合は5年以下の懲役または500万円以下の罰金が科される厳しい罰則が設定されており、警察が捜査に着手して逮捕に至る事例も出ています。投稿を見たユーザーが通報し、ネット上で拡散されることで炎上・特定が加速し、犯人が摘発されるケースが増えています。SNS運営会社も明らかな虐待動画は削除やアカウント凍結する方針を強めています。

競馬や競犬レースは公営競技やレジャーとして多くの人が楽しむ一方、動物福祉の観点から「過酷な調教」「故障時の扱い」などが問題視されています。日本では競馬は競馬法で、犬レース（競犬）は公営競技としては実施されていませんが、海外では行われる例があります。国内の競馬では、JRAや地方競馬組織が調教師や騎手に対して安全基準や獣医ケアを徹底するルールを設けており、不必要な虐待行為は禁じられています。ただし、過度な鞭使用や傷病馬の引退後の扱いなど、常に社会的な批判が存在する分野です。

動物園や水族館で行うボランティア活動（餌やり体験の補助、施設内誘導、清掃など）は、原則として動物取扱業の登録は不要です。あくまで施設が第一種動物取扱業などの手続きを踏んでおり、その下でボランティアが労働や補助を行う形だからです。ただし、ボランティアが直接動物を扱い、来場者に展示する立場に近い場合は、施設の指揮命令の範囲内で活動することが望ましいです。報酬がないからといって法的責任が免除されるわけではなく、誤った飼育行為や事故があれば施設の管理責任の下で対処が必要となります。

動物園でのショーやパフォーマンスは、動物行動の一環として訓練されているケースが多いですが、動物愛護管理法上は「適正な飼育管理の下で苦痛を与えない限り」直ちに違法とはなりません。とはいえ、芸をさせるために過度のストレスや苦痛を与えるような訓練法であれば、虐待に該当する可能性があります。欧米では動物ショーを制限したり、イルカショーやクマの芸を禁止する国も増えており、日本でも動物福祉の観点からショーのあり方に疑問を呈する声があがっています。

多くの自治体では、動物愛護センターは都道府県や市町村の組織に属しており、職員は地方公務員として採用されるケースが一般的です。そのため、公務員試験（地方上級や中級など）に合格した上で、希望部署として動物愛護関連業務に配属されることがあります。業務内容は、迷子犬猫の保護・返還、譲渡活動、動物虐待の通報対応、飼育環境の指導、啓発イベントの企画など多岐にわたります。一部の自治体では臨時職員やアルバイトを募集することもありますが、正規職員として働くには公務員として採用されるパターンが大半です。

動物愛護団体が劣悪飼育環境（多頭崩壊）から犬や猫をレスキューする際、実は動物の所有権が飼育者にあるため、所有者の同意なく勝手に連れ出す行為は法的に問題になる場合があります。正当な手順としては自治体や警察を通じて「飼育放棄の意思を確認する」または「虐待・ネグレクトの疑いで行政処分を行う」などが必要です。団体が独自に踏み込んで動物を引き上げるには、飼い主の承諾文書を得るか、行政が強制力を発動する協力体制が望まれます。違法に踏み込むと不法侵入や窃盗となり得るリスクがあります。

野生動物は多くが鳥獣保護管理法や種の保存法で保護されており、勝手に捕獲して飼育する行為は原則禁止されています。また、負傷した野生動物を保護する場合も、指定期間内に都道府県の野生動物保護担当や専門施設へ相談しなければならない規定があることが多いです。猛禽類や野鳥、リスなど野生動物を「かわいいから」と自宅で飼育すると、違法飼育として罰則の対象になる可能性が高いです。絶滅危惧種だと罰金や懲役刑が科される重大案件となることも。